Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Foxd2O35392 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Foxd2O35392 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxd2O35392 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxd2O35392 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxd2O35392 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxd2O35392 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxd2O35392 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxd2O35392 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxd2O35392 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxd2O35392 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxd2O35392 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms