Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc18a3O35304 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc18a3O35304 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc18a3O35304 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc18a3O35304 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc18a3O35304 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc18a3O35304 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc18a3O35304 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc18a3O35304 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc18a3O35304 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc18a3O35304 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc18a3O35304 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc18a3O35304 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc18a3O35304 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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