Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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