Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20795J3QP49 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms