Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm3727J3QM54 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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