Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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