Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AK157302I3ITR1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AK157302I3ITR1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AK157302I3ITR1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AK157302I3ITR1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AK157302I3ITR1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AK157302I3ITR1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AK157302I3ITR1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AK157302I3ITR1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AK157302I3ITR1 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms