Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf148G3X9R7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms