Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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H2-M1F7CXU4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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H2-M1F7CXU4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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H2-M1F7CXU4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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H2-M1F7CXU4 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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H2-M1F7CXU4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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H2-M1F7CXU4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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H2-M1F7CXU4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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H2-M1F7CXU4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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