Protein–RNA interactions for Protein: F7BE84

Ankrd50, Ankyrin repeat domain 50 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ankrd50F7BE84 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd50F7BE84 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd50F7BE84 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd50F7BE84 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ankrd50F7BE84 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd50F7BE84 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ankrd50F7BE84 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd50F7BE84 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ankrd50F7BE84 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd50F7BE84 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ankrd50F7BE84 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ankrd50F7BE84 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ankrd50F7BE84 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd50F7BE84 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd50F7BE84 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ankrd50F7BE84 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ankrd50F7BE84 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ankrd50F7BE84 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ankrd50F7BE84 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms