Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms