Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Myo5cE9Q1F5 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms