Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc8E9PWG2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms