Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Olfr1535-201ENSMUST00000068163 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms