Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb3D3Z6J4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms