Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm3543D3Z235 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm3543D3Z235 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm3543D3Z235 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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