Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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BC048679D3YXE9 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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BC048679D3YXE9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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