Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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