Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms