Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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