Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint7A7XV04 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint7A7XV04 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint7A7XV04 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint7A7XV04 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Skint7A7XV04 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Skint7A7XV04 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms