Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms