Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Pramef6A2A8M8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Pramef6A2A8M8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Pramef6A2A8M8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Pramef6A2A8M8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms