Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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