Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hdac6Q9Z2V5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hdac6Q9Z2V5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hdac6Q9Z2V5 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hdac6Q9Z2V5 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hdac6Q9Z2V5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hdac6Q9Z2V5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hdac6Q9Z2V5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hdac6Q9Z2V5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Hdac6Q9Z2V5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Hdac6Q9Z2V5 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Hdac6Q9Z2V5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Hdac6Q9Z2V5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms