Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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