Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

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Length 792 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Nek4Q9Z1J2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nek4Q9Z1J2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nek4Q9Z1J2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek4Q9Z1J2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms