Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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Cldn13Q9Z0S4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Cldn13Q9Z0S4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Cldn13Q9Z0S4 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
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Cldn13Q9Z0S4 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Cldn13Q9Z0S4 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Cldn13Q9Z0S4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Cldn13Q9Z0S4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Cldn13Q9Z0S4 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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