Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Psmb3Q9R1P1 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Psmb3Q9R1P1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms