Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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