Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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