Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim44Q9QXA7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Trim44Q9QXA7 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Trim44Q9QXA7 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms