Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sfmbt1Q9JMD1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sfmbt1Q9JMD1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms