Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Upk3aQ9JKX8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Upk3aQ9JKX8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Upk3aQ9JKX8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Upk3aQ9JKX8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Upk3aQ9JKX8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Upk3aQ9JKX8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Upk3aQ9JKX8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Upk3aQ9JKX8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Upk3aQ9JKX8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Upk3aQ9JKX8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Upk3aQ9JKX8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Upk3aQ9JKX8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Upk3aQ9JKX8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Upk3aQ9JKX8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk3aQ9JKX8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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