Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms