Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms