Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms