Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl39Q9JKF7 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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