Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnq4Q9JK97 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnq4Q9JK97 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnq4Q9JK97 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnq4Q9JK97 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnq4Q9JK97 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnq4Q9JK97 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kcnq4Q9JK97 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kcnq4Q9JK97 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kcnq4Q9JK97 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Kcnq4Q9JK97 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Kcnq4Q9JK97 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Kcnq4Q9JK97 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Kcnq4Q9JK97 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Kcnq4Q9JK97 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Kcnq4Q9JK97 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Kcnq4Q9JK97 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnq4Q9JK97 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Kcnq4Q9JK97 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms