Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm15895-201ENSMUST00000157018 731 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Atp6v1h-205ENSMUST00000192847 1662 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Pgpep1Q9ESW8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms