Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms