Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1dQ9DC28 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms