Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms