Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Subh2bvQ9D9Z7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Subh2bvQ9D9Z7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Subh2bvQ9D9Z7 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Subh2bvQ9D9Z7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Subh2bvQ9D9Z7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Subh2bvQ9D9Z7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Subh2bvQ9D9Z7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Subh2bvQ9D9Z7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Subh2bvQ9D9Z7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Subh2bvQ9D9Z7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Subh2bvQ9D9Z7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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