Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Speer4bQ9D9F7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Speer4bQ9D9F7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Speer4bQ9D9F7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Speer4bQ9D9F7 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Speer4bQ9D9F7 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Speer4bQ9D9F7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Speer4bQ9D9F7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Speer4bQ9D9F7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4bQ9D9F7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Speer4bQ9D9F7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Speer4bQ9D9F7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4bQ9D9F7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4bQ9D9F7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4bQ9D9F7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4bQ9D9F7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4bQ9D9F7 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4bQ9D9F7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4bQ9D9F7 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4bQ9D9F7 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4bQ9D9F7 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4bQ9D9F7 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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