Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gtf3c6Q9D8P7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gtf3c6Q9D8P7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gtf3c6Q9D8P7 Mrps14-203ENSMUST00000135680 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gtf3c6Q9D8P7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gtf3c6Q9D8P7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Anpep-201ENSMUST00000049004 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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