Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Alkbh4Q9D8F1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms