Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms