Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ptp4a3Q9D658 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ptp4a3Q9D658 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ptp4a3Q9D658 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ptp4a3Q9D658 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ptp4a3Q9D658 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ptp4a3Q9D658 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ptp4a3Q9D658 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ptp4a3Q9D658 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ptp4a3Q9D658 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ptp4a3Q9D658 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ptp4a3Q9D658 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ptp4a3Q9D658 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ptp4a3Q9D658 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ptp4a3Q9D658 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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