Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sgms2Q9D4B1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Sgms2Q9D4B1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Sgms2Q9D4B1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Sgms2Q9D4B1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Sgms2Q9D4B1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Sgms2Q9D4B1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sgms2Q9D4B1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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